计算机科学与工程系党总支于2002年成立，现有总支委员5名，徐志怀任党总支书记，沈东升任纪检委员，郭联志任统战委员，李苗任宣传委员，许晴媛任组织委员。同时设有一个教工党支部和六个学生党支部。
　　计算机科学与工程系党总支始终坚持以马列主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入学习十六大、十七大精神，树立和落实科学发展观，充分发挥基层党组织的战斗堡垒作用和党员先锋模范作用，进一步加强党组织的监督和保证作用，不断提高党总支的凝聚力和战斗力。几年来，计算机科学与工程系党总支的党员们同心同德，开拓进取，不断取得新的业绩。2002年计算机科学系“创最佳业绩、迎十六大召开” 作品《公民道德建设系列活动》获省委宣传部、省教育厅三等奖。2003年计算机科学系学生党支部立项项目“让道德之光永恒”获省优秀成果奖。2006年计算机科学与工程系党总支被评为省先进基层党组织。